2)Где хранятся миссии, созданные в редакторе?
Мои документы/Arma II/missions. Открытым остается вопрос, где хранятся скомпилированные миссии. Пока что я их не обнаружил.

3)Куда класть скачанные миссии?
Создаем в корневом каталоге игры папку Missions и кидаем туда.
После установки патча 1.01, папки Missions и MPMissions создаются автоматически.

4)Совместимы ли брифинги Arma I и Arma II?
Не совместимы. Мало того, система брифингов претерпела значительные изменения, а в теги теперь встраивается локализация.
Привычные стрингтейблы теперь не работают, пришла им на замену пока что непонятная конструкция.
Overview, в принципе, остался без изменений.

5)Description.ext
В этом файле описания персонажей, звуков, радиокоманд остались практически неизменны со времен ОФП. То есть, можно быть уверенным, что дескрипшн без описания диалоговых окон и шрифтов заработает.
Исключение - titles со ссылкой на стрингтейбл, повторюсь, он теперь не работает.

6)Видеоролики и camera.sqs
Основные команды камеры и скрипт camera.sqs остались нетронутыми, но теперь возможно применение эффектов постобработки - кто поиграл хотя бы в первую миссию кампании, это наверняка заметили.
clipboard.txt, в который так удобно сохранять координаты камеры, своей дислокации не сменил. Как и в Арма I, он находится по адресу
Диск с виндой:\Documents and Settings\имя_юзера\Local Settings\Application Data\ArmA 2

7)Как заставить мелких животных стоять на месте?
Пишем у них в init'e : this disableAI "move"

8) Где взять список команд?
ЗДЕСЬ

9) Где взять список юнитов и оружия для добавления вручную?
ЗДЕСЬ